Symptomene på melkeallergi, eller melkeproteinallergi, kan oppstå flere steder på kroppen og kan komme både fra huden, magen og luftveiene.
Hudsymptomene på melkeallergi kan være kløe, rødhet, utslett, utbrudd av eksem og elveblest. Symptomene fra magen kan være magesmerter, diaré, forstoppelse og oppkast. Tetthet og pusteproblemer kan være symptomer fra luftveiene.
Alvorlige livstruende allergiske reaksjoner (anafylaksi) kan også oppstå, men dette er sjelden ved melkeallergi.